Bioinformatika GY

Alap infók:

  • T√°gyk√≥d: bioinf1u0um17gm
  • IdŇĎpont: 2017/2018. tavaszi f√©l√©v, kedd 14:00-15:30
  • Helysz√≠n: ELTE L√°gym√°nyosi Campus, D√©li √©p√ľlet, 3-114.
  • GyakorlatvezetŇĎ: Varga B√°lint
  • Kapcsolat: balorkany@gmail.com

Aktuális információk:

A gyakorlat anyagai a cluster.cs.elte.hu szerveren, a /home/data/vodor1 k√∂nyvt√°rban √©rhetŇĎk el.
A bel√©p√©shez sz√ľks√©ges felhaszn√°l√≥nevet √©s jelsz√≥t a Neptun-on kereszt√ľl k√ľldt√ľk sz√©t.

Bel√©p√©shez eml√©keztetŇĎ:
A szerverre az ssh protokol használatával, ssh kliens segítségével tudunk belépni.

  • UNIX alap√ļ rendszerrŇĎl (Linux disztrib√ļci√≥k, pl. ubuntu) az ssh program seg√≠ts√©g√©vel:
    ssh user@cluster.cs.elte.hu
  • Windows-r√≥l: PuTTY vagy MobaXTerm seg√≠ts√©g√©vel, hostname: cluster.cs.elte.hu

2016/2017 tavaszi félévi összefoglalók:

  • 1. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/1_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 2. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/2_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 3. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/3_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 4. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/4_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 5. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/5_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 6. gyakorlat: A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/6_bioinformatika_gy_16172.pdf
  • 7. gyakorlat: A 6. gyakorlat h√°zi feladat√°t kezdt√ľk el. Nem volt √ļj dia.
  • 8. gyakorlat: A 6. gyakorlat h√°zi feladat√°t kezdt√ľk el. Nem volt √ļj dia.

2016/2017 ŇĎszi f√©l√©vi √∂sszefoglal√≥k:

  • 1. gyakorlat: Rosalind INI1, Rosalind INI2. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/1_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 2. gyakorlat: Linux parancssor. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/2_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 3. gyakorlat: Rosalind INI3, Rosalind INI4. Dia nem volt.
  • 4. gyakorlat: Rosalind INI5, Rosalind INI6, Rosalind DNA. HF: Rosalind RNA, Rosalind REVC. Dia nem volt.
  • 5. gyakorlat: Rosalind GC, Rosalind PROT. HF: Rosalind HAMM, Rosalind SUBS. Dia nem volt.
  • 6. gyakorlat: Rosalind INI, Rosalind DBPR. HF: Rosalind FRMT. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/6_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 7. gyakorlat: HF: MSP Finder. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/7_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 8. gyakorlat: HF: MyBlastn. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/8_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 9. gyakorlat: uaz mint az elŇĎzŇĎ gyakorlaton
  • 10. gyakorlat: HF: BrainGraph. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/10_bioinformatika_gy_16171.pdf
  • 11. gyakorlat: Az elŇĎzŇĎ feladatr√≥l besz√©lt√ľnk, ami tov√°bbra is HF. J√∂vŇĎ h√©tre v√°rom a beadand√≥kat emailben.

2015/2016 tavaszi félévi összefoglalók:

  • 1. gyakorlat: Rosalind INI1, Rosalind INI2. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/1_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 2. gyakorlat: Linux parancssor, VIM, Python sztringek √©s list√°k. HF: Rosalind INI3. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/2_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 3. gyakorlat: Rosalind INI4, Rosalind INI5. HF: Rosalind INI6. Dia most nem volt.
  • 4. gyakorlat: Rosalind DNA, Rosalind RNA, Rosalind REVC. HF: Rosalind PROT. Dia most nem volt.
  • 5. gyakorlat: Rosalind HAMM, Rosalind SUBS.¬†HF: Rosalind GC. Dia nem volt.
  • 6. gyakorlat: Rosalind INI, Rosalind DBPR. HF: Rosalind FRMT. A dia a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/6_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 7. gyakorlat: HF: MSP Finder. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/7_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 8. gyakorlat: HF: MyBlastn. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/8_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 9. gyakorlat: HF: Adatt√°bl√°zat gener√°l√°sa aging/non-aging feh√©rj√©k klasszifik√°ci√≥j√°hoz. A pontos le√≠r√°s a di√°n, ami a cluster.cs.elte.hu szerveren van:/home/data/vodor2/bioinformatika_gyakorlatok/9_bioinformatika_gy_15162.pdf
  • 10. gyakorlat:Nem volt dia. Az elŇĎzŇĎ k√©t feladatr√≥l besz√©lt√ľnk. HF sem volt √©s nem is lesz m√°r ebben a f√©l√©vben. J√∂vŇĎ h√©tre (esetleg k√©t h√©t m√ļlva) k√©rem az √∂sszefoglal√≥kat.

2015/2016 ŇĎszi f√©l√©vi √∂sszefoglal√≥k:


2014/2015 tavaszi félévi összefoglalók: